Characterization of C17orf45 as a novel target of the Wnt/B-catenin pathway
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2009
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: TUNCAY ŞEKER
Danışman: NECLA BİRGÜL
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Wnt yolağının bir elemanı olan B-katenin tümör oluşumunda önemli bir rol oynamaktadır. Önceki çalışmamızda B-katenin mutant formunu yüksek miktarda üreten karaciğer kanseri hücresi Huh7'de Wnt/B-katenin/TCF yolağı tarafından etkilenen aday genler tespit edilmişti. Gen anlatımının seri analizi (serial analysis of gene expression - SAGE) ve mikrodizin yongaları metodlarıyla TCF aktivitesi yüksek ve düşük Huh7 hücreleri arasında global gen anlatımı karşılaştırılması yapılmıştı. Bu karşılaştırma neticesinde Wnt/B-katenin/TCF4 yolağı yüksek olan hücrelerde C17orf45 geninin mRNA seviyesinin arttığı bulunmuştur. Bu çalışmada C17orf45 geni Wnt/B-katenin yolağının yeni hedef geni olarak tespit edilmiştir. Hücrelerin lityum klorür tuzuna maruz bırakılması, GFP/Lusiferaz raportör analizi ve immünoçöktürme deneylerinin bulguları baz alınarak C17orf45 Wnt hedef geni olarak tanımlanmıştır. C17orf45 geni ile daha önce hiç bir çalışma yapılmamış olup sagereveal biyoinformatik yazılımı ile çeşitli beyin kanserlerinde arttığı öngörülmektedir. Bu bağlamda C17orf45 geninin olası tümör oluşumu ile ilgisini araştırmak için insan beyin dokularında gen anlatım analizi ve U373-MG astrositom hücre hattında hücre büyüme testi yapılmıştır. C17orf45 proteininin araştırmalarında başlangıç olarak hücre içi lokalizasyonuna bakılmıştır. GFP ile birleşik C17orf45 proteini kullanılarak lokalizasyon mitokondri olarak tespit edilmiştir. Wnt sinyal yolağının yeni hedef genlerinin tespit edilmesi kanser patofizyolojisini anlamak adına önemlidir. Özet olarak bu çalışma Wnt yolağı tarafından hedeflenen ve tümör oluşumu ile ilgili olabilecek daha önce tanımlanmamış bir gen sunmaktadır.