Identification of interaction partners of unzipped, a novel cell adhesion molecule
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2013
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: GAMZE AKGÜN
Danışman: ARZU ÇELİK FUSS
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Beyin, birçok organizmanın vücudundaki en karmaşık organdır. Bu karmaşık yapının oluşumu aksonların doğru hedeflerini bulma yeteneğine bağlıdır. Aksonlar sinaptik bölgelerine doğru ilerlerken çekici veya itici olabilen işaretler tarafından yönlendirilmektedir. Akson hücre yüzeyindeki akson yönelim molekülleri ile rehber işaretler arasındaki negatif ve pozitif adhezyon, aksonların üzerinde uzadığı yolu belirlemektedir. Bazı aksonlar (öncü aksonlar) işaretler tarafından yönlendirilirken, diğerleri (takipçi aksonlar) önceden oluşmuş yolları takip etmektedir. Nöron ve glia hücrelerinde anlatılan yeni bir hücre adhezyon molekülü olan Unzipped (Uzip) Drosophila koku reseptör nöronlarının (KRN) doğru hedeflerine ulaşmalarında görev almaktadır. Unzipped, öncü nöronlarda anlatılmaktadır ve bu nöronlar gliadan gelen Uzip ile homofilik etkileşimle yönlendirilmektedir. Öncü nöronlarda bulunan Uzip?in, takipçi aksonlar üzerindeki diğer adhezyon molekülleri ile heterofilik etkileşimlerde bulundukları tahmin edilmektedir. Hipotezimizi kanıtlamak ve Unzipped?in yönelim işlevinin mekanizmasını anlamak amacıyla, Uzip?in etkileşim partnerlerini bulmayı amaçladık. Bu amaçla, ko-immünopresipitasyon deneyini takiben, kütle spektrometresi analizi gerçekleştirdik. Bu analizle bulunan proteinler arasında, dört aday ileri incelemeler için seçilmiştir: Hts, dFMR1, EPS15 ve Syn. Kütle spektrometresi sonuçlarını doğrulamak için yapılan ko-immünopresipitasyon deneyleri, bu adaylar ve Uzip arasında hiçbir fiziksel etkileşim göstermemiştir. Ayrıca, bu dört proteinin anlatım örüntüsünün incelenmesi, çoğu durumlarda, Hts dışındakilerin Unzipped ile kolokalize olmadıklarını ortaya koymuştur ve Hts?nin de etkileşim partneri olmadığı sonucuna varılması için daha fazla inceleme gerekmektedir. Bunun yanında, Uzip?in Drosophila sinir sistemi gelişim aşamalarındaki endojen anlatım örüntüsü, Flag-HA-işaretli Uzip füzyon proteinin anlatım örüntüsü incelenerek ortaya çıkarılmıştır.