Identification and in vivo analysis of putative WNT target genes with effective roles in cancer


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2012

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: İPEK EVEN

Danışman: NECLA BİRGÜL

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Hepatoselüler karsinoma (HCC) gelişiminde rol oynayan tetikleyici faktörlerden biri de, hücre içinde mutant ß-katenin birikimi sonucu ortaya çıkan Wnt/ß-katenin sinyal yolağının olağandışı aktivasyonudur. Daha önce grubumuz tarafından, HCC hücre hattında anlatımları ß-katenin'in yüksek anlatımına bağlı olarak değişen çeşitli genler tespit edilmiştir. Bu genlerin, Wnt/ß-katenin sinyal yolağında yer alan olası hedef genler olarak görev yaptığı ve kanserde etkin rol oynayabileceği düşünülmektedir. Bu çalışmada, tespit edilen olası Wnt/ß-katenin hedef genlerinin tümör oluşumundaki rollerinin Drosophila'da in vivo bir analiz ile aydınlatılması amaçlanmıştır. Bu amaçla, seçilen 16 olası Wnt/ß-katenin hedef genin anlatımları iki farklı Drosophila kanser modelinde RNA interferens (RNAi) tekniği ile baskılanmış, bu baskılamaların tümör ve metastaz oluşumlarına olan etkileri incelenmiştir. Gerçekleştirilen bu RNAi analizinin sonuçları, incelenen 16 olası hedef gen için tümör oluşumunda yeni roller ortaya koymuştur. Analiz edilen 13 olası hedef genin baskılanması, tümör ve metastaz oluşumlarını tetikleyerek bu genler için tümör baskılayıcı yönde bir rol ortaya koymuştur. Diğer 3 hedef genin baskılanması ise tümör ve metastaz oluşumlarını azaltarak ve analiz edilen dokularda gelişimi olumsuz yönde etkileyerek, bu genler için onkogenik ya da gelişimsel bir rol ortaya koymuştur. Elde edilen bu bulgular, Wnt/ß-katenin sinyal yolağının karakterizasyonuna destek vererek çeşitli kanser türlerinde diagnostik ve terapötik süreçlere ışık tutacak ve kanser araştırmalarına katkı sağlayacaktır.