Investigation of the effects of ochratoxin-a on global protein sumoylation

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2022

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: İREM DENİZLİ

Danışman: İBRAHİM YAMAN

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Özellikle Aspergillus ve Penicillum türleri tarafından üretilen ikincil bir metabolit olan Okratoksin A (OTA), günlük tüketilen mısır gevreği, kahve, et ve süt ürünleri gibi gıdalarda kontaminant olarak bulunur. OTA, etki şekli henüz tam olarak anlaşılmamış potansiyel bir kanserojen toksindir. OTA'nın, hayati hücresel aktivitelerden sorumlu MAPK/Erk1-2 ve PI3K/Akt sinyal yollarını deregüle ettiği bilinmektedir. Bu nedenle OTA'nın kanserojen ve toksik etkilerinin altında yatan mekanizmaların belirlenmesi büyük önem taşımaktadır. SUMOyilasyon, hücresel homeostazda ve hücrenin hayati fonksiyonlarının düzenlenmesinde önemli roller oynayan translasyon sonrası modifikasyonlardan biridir. OTA'nın global protein SUMOyilasyon değişiklikleri üzerindeki etkilerini ve bu değişikliklerin MAPK/Erk1-2 ve PI3K/Akt sinyal yollarının OTA kaynaklı aktivasyonlarına katkılarını inceleyen bir çalışma bulunmamaktadır. Bu Yüksek Lisans projesinde, önce OTA'nın ölümsüzleştirilmiş insan proksimal tübül epitelyal HK-2 hücre hattında oksidatif stresi indüklediğini gösterdik. Daha sonra, OTA maruziyetinin, OTA kaynaklı oksidatif stres ile bağlantılı olabilecek olan global protein SUMOyilasyonunda ve PI3K/Akt ve MAPK/Erk1-2 yollarının aktivasyonunda değişikliklere yol açtığını gösterdik. Ayrıca, ML-792 kullanılarak global SUMOyilasyonu inhibe edildiğinde OTA kaynaklı MAPK/Erk1-2 yolu aktivasyonunun etkilenmediğini gösterdik. Buna karşılık, sonuçlarımız, OTA maruziyeti altındayken Akt'nin fosforilasyonu için global SUMOyilasyonun gerekli olduğunu gösterdi. Bütün sonuçlar göz önüne alındığında, verilerimiz SUMOyilasyonun OTA maruziyeti altında hücresel hayatta kalmada önemli bir rol oynayabileceğini düşündürmektedir. Son olarak, immün-çökeltme için düşük verimliliği ortadan kaldırmak amacıyla stabil SUMO-1- ve SUMO-2-aşırı ifade eden HK-2 hücre hatları oluşturduk. Bu hücre hatlarını kullanarak, OTA maruziyeti altındaki olası SUMO hedeflerini Kütle Spektrometrisi Analizi yoluyla tespit edebileceğiz.