Identification of the upstream regulators of interferon regulatory factor 4 (IRF4) expression in melanoma cells
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2015
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: AHMET BUĞRA TUFAN
Danışman: NEŞET CEVDET TOLGA EMRE
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Melanoma pigment üreten hücrelerden kökenlenir. Geç evrelerde ise metastatik melanoma en agresif hastalıklardan birisi olarak bilirnir ve kötü bir prognoza sahiptir. IRF4 interferon düzenleyici faktör transkripsiyon ailesine aittir. IRF4 ekspresyonu NF-κB gibi mitojenik uyarıcılar tarafından kontrol edilir ve bu ekspresyon T-hücre lösemisi, Multipl Miyelom (MM) ve B-hücre lenfoması ile ilişkilendirilir. İmmün hücrelerden kökenlenen kanserlere ek olarak, IRF4'un yüksek seviyelerde eksprese edilmesi melanoma hücre hatlarında ve hasta örneklerinde gözlemlenmiştir. Buna ilave olarak melanoma hücre hatlarının yaşamlarının IRF4'e bağımlı olduğu yakın zamanda gösterilmiştir. Genom düzeyindeki ilişkilendirme çalışmaları (GWAS) ise IRF4 lokusunda hastaların mel-anomaya yatkınlığını belirleyen bir SNP bulmuştur. Bu projedeki amaç ise hangi sinyal yolaklarının IRF4 ekspresyonunu melanomada düzenlediğinin araştırılmasıdır. Eğer IRF4'un anlatımının düzenlenmesine dair fikir sahibi olabilirsek, bu çalışma melanoma için yeni tedavi stratejilerinin gelişmesine yol açacaktır. IRF4'un bilinen düzenleyicilerine ait bilgilerimiz çoğunlukla immün hücrelerden gelmektedir. IRF4'un bilinen düzen-leyicilerine bağlı olarak, üç aday yolağı, IRF4'un ekspresyonunu melanomada aday düzenleyici olarak seçtik. Küçük moleküler bileşenler kullanarak, bu yolakların aktivitesini modüle ettik. Daha sonra, IRF4 ekspresyonunu mRNA ve protein düzeyinde muamele edilmiş hücrelerde kontrol ettik. Sonuçlarımız bu lenfosit alakalı yolaklardan birisinin IRF4'un melanoma hücrelerindeki ekspresyonunda rol aldığını önermektedir.