Production of nanobodies targeting il-1R1

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2024

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: GİZEM ÇİLE

Danışman: ARZU ÇELİK FUSS

Özet:

IL-1R1, IL-1 ailesi reseptörlerinin bir üyesi olup, doğal bağışıklık ve enflamasyonun düzenlenmesinde önemli roller oynar. IL-1α ve IL-1ꞵ , IL-1R1'in ligandları olup, ateşin indüklenmesi, lenfositlerin proliferasyonunun uyarılması ve pro-inflamatuar sitokinlerinin salgılanması gibi çeşitli enflamatuar tepkilerde rol oynarlar. IL-1 sinyalindeki düzensizlikler enflamatuar hastalıklara yol açar ve genellikle Canakinumab, Anakinra ve Rilonacept gibi IL-1 inhibitörleri tedavi amaçlı kullanılır. Bu tedaviler hastalık belirtilerinin hafifletilmesinde etkili olmakla beraber bazı sınırlamalara sahiptir. Nanokorlar, sadece ağır zincirden oluşan antikorların değişken fragmanlarından elde edilir. Küçük boyutları, yüksek afiniteleri, stabiliteleri ve çözünürlükleri gibi özellikleri nedeniyle diğer IL-1 inhibitörlerine alternatif olabilirler. Bu yüzden bu çalışma anti-enflamatuar ajanlar olarak anti-IL-1R1 nanokorları üretmeyi amaçlamıştır. Bu doğrultuda iki farklı strateji izlenmiştir: IL-1R1'e yüksek affinite ile bağlandığı tahmin edilen bir nanokorun gen sentezinin yapılması ve immünize edilmiş lamalardan elde edilen nanokorların üretimi. Gen sentezi başarılı olmasına rağmen, bakteride nanokorun ifadesi sağlanamamıştır. Ancak, immünize edilen lamalardan elde edilmiş olan nanokorlar başarılı bir şekilde saflaştırılmış ve karakterize edilmiştir. IL-1R1'e yüksek affinite ile bağlanan ondan fazla nanokor tespit edilmiş ve içlerinden 3WEB23 ve 2TED12 nanokorlarının hücre kültüründe IL-1R1'i etkili bir şekilde inhibe ettiği gözlemlenmiştir. Bu nanokorlar, enflamatuar hastalıklara karşı umut verici terapötik adaylardır, ancak in vivo fonsiyonelliklerinin daha fazla araştırılması gerekmektedir. Epitop gruplaması (epitope binning) deneylerinde, bu iki aday nanokorların bağlanma kapasitelerinin diğer yüksek affiniteli nanokorlar tarafından engellenmediği gözlemlenmiştir. Bu yüzden epitop gruplaması deneyleri nanokorların multivalent nanokor üretiminde kullanılmasını desteklemektedir. Genel olarak, bu çalışma inflamatuar hastalıklar için alternatif terapötik adaylar olarak iki anti-IL-1R1 nanokoru belirlemiştir.