An investigation of seed dormancy cycling mechanisms and local adaptations in arabidopsis thaliana
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2024
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: ATALAY NALLIDERE
Danışman: STEVEN FOOTITT
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Tohumlar çevresel işaretleri takip ederek çimlenmek için elverişsiz koşullardan kaçınır ve büyüme sezonunun içerisinde çimlenirler. Uyuşukluğun indüklenmesine ve salınmasına yol açan çevresel sinyallere olan duyarlılık tohumların genetiğine göre farklılık göstermektedir. Bu çalışmada yazın ve kışın büyüme gösteren iki Arabidopsis thaliana ekotipi arasında üretilmiş rekombinant kendilenmiş hatlardan oluşan haritalama popülasyonu bir tohum uyuşukluğu döngüsüne maruz bırakılmıştır. Popülasyon tepkisindeki fenotipsel çeşitlilikten yararlanılarak, tohum uyuşukluğu döngüsünün farklı yönlerini niteleyen 10 lokus keşfedilmiştir. Sonuçlara göre, birincil uyuşukluk halinin ve tohumların 5°C'de soğuğa maruz bırakılması ile oluşan ikincil uyuşukluk halinin etkisindeyken DOG1 25°C'deki çimlenme potansiyelini kontrol etmektedir. Fakat tohumların soğuğu takriben 25°C'de sıcağa maruz bırakılmasıyla oluşan ikincil uyuşukluk halinin etkisindeyken, 10°C'deki çimlenme potansiyeli DOG1 tarafından kontrol edilmemektedir. Bu koşullar altında çimlenmeyi kontrol ettiği tespit edilen Peak 5'in içerisindeki aday bir gen, ATHB-5, açık erişimdeki transkriptom verileri kullanılarak gerçekleştirilen bir ağ analizi ile tespit edilmiştir. ATHB-5 tohum uyuşuklukluğu döngüsünü kontrol eden lokal adaptasyonların potansiyel bir kaynağını teşkil etmektedir. Tohum uyuşukluğunu kontrol eden lokusların tespiti, dog1-2 ve mft2 ile üretilmiş yeni bir çift mutantın analizi, ve ağ analizinin sonuçları, Arabidopsis thaliana'da tohum uyuşukluğu döngüsünün regülasyonuna dair yeni bir perspektif sunmaktadır.