Characterization of adipokinetic hormone receptor in stick insect, Carausius morosus

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2018

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: MERVE GİZEM SINMAZ

Danışman: NECLA BİRGÜL

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Adipokinetik hormone (AKH) bir böcek nöropeptiti olup, insanlardaki gonadotropin-salgılayan hormonun ortoloğu olarak da bilinir. Corpora cardiaca'dan salgılanır ve enerji mobilizasyonu için genellikle depo lipitleri üzerinde etkisini gösterir. Kan hemolenfindeki trehaloz seviyesinin, kalp atışı sıklığının ve protein sentezinin artması gibi birçok çeşitli fizyolojik fonksiyonlarda da yer alırlar. Ayrıca bazı böcek türlerinde yağ asitlerinin ve RNA sentezinin inhibe edilmesinde de görev yaparlar. Kendilerine karşılık gelen adipokinetik hormone reseptörü (AKHR) olarak isimlendirilen G-protein kenetli reseptörleri (GPCR) aktive ederler. Şimdiye kadar birçok AKHR çalışılmış, ancak değnek böceği C.morosus'takiler çalışılmamıştır. Değnek böceğinin transkriptom verisini kullanılarak, bu böceğe ait adipokinetik hormone reseptör (CamAKHR) ve adipokinetik hormon (CamAKH) tanımlanmıştır. Değnek böceğine ait AKHR'nin homoloji modellemesi, kenetlenme analizi ve moleküler dinamik yöntemleri ile karakterize edilmesi ve bu sayede yeni bir nöropeptit-esaslı yeni-jenerasyon pestisit üretimine katkı sağlaması amaçlanmıştır. Çalışmanın sonunda ligandın bağlanmasında önem taşıyan on üç rezidünün, CamAKHR modelinin çoğunlukla transmembran 6, transmembran 7 ve hücre dışı ilmek 2 bölgelerinde yer aldığı gözlemlenmiştir. Bu on üç rezidüden altısı farklı böceklerde de korunmuş halde bulunduğundan, önerilen bağlanma cebi CamAKHR'nin TM2, TM3, TM6 ve TM7 bölgelerine denk gelen Glu246, Arg269, Tyr423, Tyr430, Lys446 and Phe449 rezidülerini içermektedir.