A study on protein and DNA analysis by capillary electrophoresis

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 1999

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: ASUMAN NEVRA ÖZER

Danışman: ŞEFİKA KUTLU ÜLGEN

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

ÖZET Bu çalışmada, bazı proteinler için bir kapiler elektroforez metodu geliştirmek amacıyla, sığır albumini, insan serum proteinleri, Taql, EcoRİ, Pstl restriksiyon enzimleri ve polimeraz zincir reaksiyonlanyla amplifiye edilmiş DNA kısımlan silika kapiler kolonlarda analiz edildi. Lineer poliakrilamid içeren tampon çözeltiyle dinamik kaplama ve jel dolu kapiler kolonlar kullanılan jel elektroforez metotları, 491 ve 488 baz çiftine sahip kistik fibroz taşıyıcısı Türk hastalardan alınmış DNA parçalarını ayrıştırmak için kullanıldı. Değişik tampon çözeltileri, kolon boyutları, dedektör dalga boyu, polarite, voltaj, örnek injeksiyon modu ve miktarının analitik parametreler üzerindeki etkileri incelendi. Hızlı ve verimli ayrıştırma için mümkün olan en yüksek voltajda çalışmanın ve proteinler için en uygun dalga boyunun 214 nm olduğu gözlendi. Kısa kolon kullanımı erken protein çıkışma, daha az bant genişlemesine ve dar piklere sebep oldu. TBE tampon çözelti sisteminin restriksiyon enzimleri için uygun olmadığı bulundu. Serum proteinleri içinse Dolnik çözeltisinin kullanımının verimli olduğu görüldü. DNA kısımlarının incelenmesinde, dinamik kaplama metodunun optimizasyonu veya lineer poliakrilamidle statik kaplama metodunun geliştirilmesine karar verildi.