MENA, BRI3 and HSF2 as novel transcriptional targets of the Wnt/beta-catenin pathway
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2008
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: AYAZ NAJAFOV
Danışman: NECLA BİRGÜL
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Wnt/beta-katenin yolağı embriyonik gelişimde ve kanser oluşumunda önemli roller oynadığından, bu yolağın elemanları ve hedef genleri, gelişim ve kanser biyolojisinde önemli çalışma alanları oluşturmaktadır. Beta-katenin bir transkripsiyon faktörü olup birçok kanserde düzensizdir. Wnt proteini Frizzled reseptörüne bağlanmaması durumunda, beta-katenin sitoplazmada glikojen sintaz kinaz 3b (GSK3b) tarafından fosforile edilip degrede edilmektedir. Wnt proteinin reseptöre bağlanması halinde GSK3b inaktif hale getirilmekte ve beta-kateninin sitoplazmada birikerek hücre çekirdeğine transfer edilip, embriyonik gelişim ve hücre devri ile alakalı çeşitli genlerin anlatımını başlatan T-hücre faktörü / lenfoid enhancer faktörü (Tcf/Lef) transkripsiyon faktörleri ailesini aktive etmektedir.Genom-boyu transkriptomiks çalışmalarına dayanan bu çalışmada, Wnt/beta-katenin yolağının yeni hedef genlerin tespiti amaçlanmıştı. Bu bağlamda MENA (Mammalian enabled homologue), BRI3 (Brain protein I3) ve HSF2 (Heat-shock factor 2) genleri üzerinde yoğunlaştık. Bu genler, degrede-edilemeyen beta-kateninin anlatımı sonrasında anlatımları artığından ve promotör bölgelerinde olası TCF4-bağlanma sekansları bulundurmaları nedeniyle seçildi. MENA, BRI3 ve HSF2 genlerinin Wnt/beta-katenin yolağı tarafından kontrol edilip edilmediğni tespit etmek için GSK3b'yi inhibe eden ve Wnt/beta-katenin yolağının suni aktivasyonunu sağlayan lityum klorür tuzuna hücreler maruz bırakılarak MENA, BRI3 ve HSF2 genlerinin anlatımının arttığı gözlemlendi. Ayrıca, lusiferaz rapörtör analizi ve kromatin immünoçöktürme analizi ile beta-katenin ile MENA, BRI3 ve HSF2 genlerinin promotör bölgeleri arasında bağlantı olduğu tespit edildi. Son olarak, karşılaştırmalı RT-PCR analizi ile altı farklı kanser hücre hattı ve insan beyin tümör örneği MENA ve beta-katenin (CTNNB1) anlatımı için analiz edildi ve bir korelasyon gözlemlendi. Sonuçlarımız, MENA, BRI3 ve HSF2 genlerinin Wnt/beta-katenin yolağının yeni hedef genleri olduğunu kanıtlamaktadır.