Transcriptome-wide analysis of iroc target genes in the Drosophila olfactory system

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2018

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: İBRAHİM İHSAN TAŞKIRAN

Danışman: ARZU ÇELİK FUSS

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Bir organizma için dış çevreyi algılamak çok hayatidir ve bu algılama çeşitli duyu sinirleri tarafından sağlanmaktadır. Bu sinir hücreleri, daha sonra çeşitli spektral hassasiyeti olan sinir hücrelerine dönüşen öncül duyu organı hücreleri (SOP) tarafından üretilirler. Koku sistemindeki bu sinir hücresi çeşitlenmesinin moleküler mekanizması halen tamamen bilinmemektedir. Drosophila melanogaster koku sistemi, sinir hücresi çeşitlenmesine çok iyi bir örnektir. Bu sistemin elemanlarının az sayıda olması ve şimdiye kadar iyi tanımlanmış olması bu sistemi çalışmaya uyumlu hale getirmiştir. Drosophila koku sistemi anten ve maksiller palp olarak adlandırılan iki koku organı ve 50 farklı koku sinir hücresi (ORN) sınıfından oluşur. Koku sinir hücreleri sensilaların içerisinde bulunurlar ve her sensila birden dörde kadar sayıda sinir hücresi barındırabilir. Bu çalışma çerçevesinde biz bir TALE sınıfına ait gen düzenleyici ailesinden olan iroC (Iroquois Complex) gen düzenleyicilerine odaklandık. Enhancer trap analizleri IroC genlerinin iki koku organında da ifade edildiğini gösterdi. IroC hedef genlerinin hangileri olduğunu tespit etmek için genom geneli transkriptom yaklaşımı kullandım ve IroC üçlü mutant dokularından izole edilmiş anten ve maksiller palp dokularına RNA sekanslama deneyini yaptım. Sonuç olarak 11 tane diferansiyel bir şekilde ifade edilmiş koku reseptör geni ve 23 tane diferansiyel bir şekilde ifade edilmiş gen düzenliyici buldum. Difarensiyel bir biçimde ifade edilmiş koku reseptör genlerini qRT-PCR yöntemi ile doğruladım.