Investigation of the role of IroC in asymmetric cell division


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Boğaziçi Üniversitesi, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, FEN BİLİMLERİ ENSTİTÜSÜ, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2019

Tezin Dili: İngilizce

Öğrenci: DURAN EMRE KANACI

Danışman: ARZU ÇELİK FUSS

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Drosophila melanogaster koku sistemi geniş bir nöral çeşitliliğe sahiptir. Koku reseptör nöronları (ORN), duyu organı prekürsörlerinden (SOP) kökenlenen duyu organ soyağacı içinde, pupa gelişimi sırasında farklılaşırlar. ORN farklılaşması, koku sistemindeki nöral çeşitliliği arttıran ilk fazdır. Çeşitli hücre kaderi belirleyiciler, ORN prekürsörleri üzerine kombinasyon halinde etki ederler ve ORNlerin farklı hücre kaderleri kazanmasını sağlarlar. Hücre kaderi belirleyiciler, duyu organ soyağacı boyunca asimetrik hücre bölünmesi ile dağıtılırlar ve hücre tipi-spesifik markör olarak kullanılabilirler. Biz de bu markörları kullanarak, ilgilendiğimiz gen ailesi olan IroC'nin (Iroquois kompleksi) koku sistemi gelişimi sırasında asimetrik hücre bölünmesi üzerine etkisini araştırmayı hedefledik. IroC, Drosophila'da üçüncü kromozom üzerinde bulunan üç genden oluşur; araucan (ara), caupolican (caup), and mirror (mirr). IroC'nin Drosophila koku organları olan anten ve maxiller palpta ifade edildiği gösterilmiştir. IroC gen ifadesi profilini anlamayı ve Gal4 sinek hatları kullanılarak daha önceden belirlenmiş gen ifadesi profilini teyit etmeyi amaçladım. Bu amacı gerçekleştirmek için ve iro proteinlerinin ifade profilleri hakkında daha iyi bir fikre sahip olmak için farklı yapılar kullanarak deneyler yaptım. Sonrasında, iro proteinlerinin fonksiyonunu çalışmak için farklı hücre tipi-spesifik markörler kullanarak klon analizi deneyleri gerçekleştirdim. Analiz sonucunda Notch proteininin iro proteinleri yokken çalışamayacağı ve hedef genlerin de negative yönde etkilendiği görüldü. Yani, iro proteinlerinin hücre kaderi belirleyici olarak çalıştıkları görüldü.